BioHack
BioHack
Хакатон по биоинформатике
1 – 3 марта 2019 | Санкт-Петербург
1 – 3 марта 2019 | Санкт-Петербург
о мероприятии
BioHack — хакатон для команд биологов и программистов по решению прикладных задач в области биоинформатики в течение 48 часов
пОБЕДИТЕЛИ BIOHACK 2019
1 место|150 000 ₽|команда Garlic
Грибкова Анна, Елисеев Антон, Беляев Роман
Проект: Разработка унифицированного алгоритма поиска геномных перестроек заданной структуры
Куратор: Дмитрий Конанов
2 место|100 000 ₽|команда SclerNET
Убогоева Елена, Дягель Анастасия, Цуринов Пётр, Валиев Иван, Замятин Владимир
Проект: Поиск «потерянной наследуемости» атеросклероза и его осложнений
Куратор: Герман Осьмак
3 место|50 000 ₽|команда TheoMAT_Gang
Бондаренко Антон, Соловьёв Ярослав, Орехов Дмитрий, Домин Антон, Газимагомедов Магомед
Проект: Fragment-based peptide assembly
Куратор: Артур Залевский
Специальный приз, команда RNA Torch
Мелешко Дмитрий, Ведерникова Дарья, Ешмагамбетова Галия, Фёдоров Александр, Зарубин Алексей
Проект: Разработка алгоритма для эффективного картирования и типирования нереференсных инсертов средней длины в транскриптомных данных (RNA-seq)
Куратор: Виктор Гурьев
Специальный приз, команда Одноногая лошадь
Николаева Евгения, Панков Викентий, Болотин Пётр, Поляков Даниил
Проект: Предсказание предшественников В-клеточной лимфомы с помощью машинного обучения
Куратор: Виктор Свеколкин
Грибкова Анна, Елисеев Антон, Беляев Роман
Проект: Разработка унифицированного алгоритма поиска геномных перестроек заданной структуры
Куратор: Дмитрий Конанов
2 место|100 000 ₽|команда SclerNET
Убогоева Елена, Дягель Анастасия, Цуринов Пётр, Валиев Иван, Замятин Владимир
Проект: Поиск «потерянной наследуемости» атеросклероза и его осложнений
Куратор: Герман Осьмак
3 место|50 000 ₽|команда TheoMAT_Gang
Бондаренко Антон, Соловьёв Ярослав, Орехов Дмитрий, Домин Антон, Газимагомедов Магомед
Проект: Fragment-based peptide assembly
Куратор: Артур Залевский
Специальный приз, команда RNA Torch
Мелешко Дмитрий, Ведерникова Дарья, Ешмагамбетова Галия, Фёдоров Александр, Зарубин Алексей
Проект: Разработка алгоритма для эффективного картирования и типирования нереференсных инсертов средней длины в транскриптомных данных (RNA-seq)
Куратор: Виктор Гурьев
Специальный приз, команда Одноногая лошадь
Николаева Евгения, Панков Викентий, Болотин Пётр, Поляков Даниил
Проект: Предсказание предшественников В-клеточной лимфомы с помощью машинного обучения
Куратор: Виктор Свеколкин
FAQ
Кто может принять участие в хакатоне?
Мы приглашаем студентов средних и старших курсов, аспирантов, выпускников вузов, интересующихся биоинформатикой, имеющих знания в области биологии, либо умеющих программировать. Неважно, какие проекты вы делали до этого. Мы ждем всех, кто не боится трудностей и готов разработать готовый проект за 48 часов.
Требуется ли знание каких-то специальных технологий и языков программирования?
Нет. Мы ждем специалистов, имеющих достаточный опыт на любом языке программирования.
Как зарегистрироваться на хакатон?
Для регистрации необходимо заполнить заявку на каждого участника индивидуально. При выборе участников мы будем обращать внимание на мотивационное письмо, которое вы должны будете написать в заявке. Регистрация открыта до 11 февраля.
Итоговый список участников будет опубликован на сайте 15 февраля.
Итоговый список участников будет опубликован на сайте 15 февраля.
Как выбрать проект?
15 февраля всем участникам, прошедшим отбор, придет письмо с инструкцией о том, как можно выбрать проект. На проект можно зарегистрироваться командой. Окончательное распределение по проектам будет в день открытия хакатона.
Есть какие-то направления или ограничения по тематике проектов?
Темы проектов из любой области биоинформатики и смежных областей. В каждой команде в идеале будут присутствовать как биологи, так и программисты, поэтому для решения задач понадобятся знания из обеих областей.
Можно подать свой проект?
Вы можете подать собственный проект, на реализацию которого у вас никак не находилось времени. Зарегистрировать проект можно с помощью формы до 8 февраля.
Можно ли участвовать в хакатоне своей командой?
К сожалению, нет. Все заявки на участие проходят индивидуальный отбор на общих основаниях. В случае, если все члены вашей команды пройдут отбор, то вероятность участия в одном проекте высокая, но гарантировать мы не можем.
Сколько длится хакатон?
BioHack длится 48 часов.
Хакатон стартует в пятницу, 1 марта, в 15:00. Презентации разработанных проектов пройдут в воскресенье, 3 марта, с 14:00 до 18:00. Организаторы обеспечат комфортные условия для работы и круглосуточный доступ к площадке.
Хакатон стартует в пятницу, 1 марта, в 15:00. Презентации разработанных проектов пройдут в воскресенье, 3 марта, с 14:00 до 18:00. Организаторы обеспечат комфортные условия для работы и круглосуточный доступ к площадке.
Обязательно работать над проектом все время на площадке?
Вы вправе выбирать количество времени, которое будете находиться на площадке и работать. Если работать в таком режиме для вас экстремально — можете отправиться домой или поспать в оборудованном для сна месте на площадке в любое время.
Что необходимо принести с собой?
Инструменты для работы
Личные вещи
- Ноутбук и зарядное устройство к нему.
- Расходные материалы, которые могут понадобиться.
Личные вещи
- Все участники будут обеспечены полноценным питанием и напитками, но если вы придерживаетесь особого питания, то его лучше взять с собой.
- Если вы планируете ночевать на площадке, возьмите спальный мешок или надувной матрас и гигиенические принадлежности (например, зубную щетку).
Организаторы
BioHack — совместный проект международной IT-компании ЕРАМ и Института биоинформатики.
Основанная в 1993 году компания EPAM является глобальным разработчиком программного обеспечения и поставщиком цифровых платформ. Объединяя свыше 22000 профессионалов, компания работает с клиентами по всему миру, используя свои отмеченные наградами центры разработки и офисы в 25 странах Северной Америки, Европы, Азии, Австралии.
В 2015 году EPAM получил главный приз от Bio-IT World на конкурсе лучших проектов в сфере медицины и биотехнологий. Компетенции компании включают в себя разработку программного обеспечения в области биоинформатики и хемоинформатики, внедрение корпоративных платформ и платформ для медицинского обслуживания, проведение аналитики, разработку эффективных алгоритмов для анализа больших данных.
В 2015 году EPAM получил главный приз от Bio-IT World на конкурсе лучших проектов в сфере медицины и биотехнологий. Компетенции компании включают в себя разработку программного обеспечения в области биоинформатики и хемоинформатики, внедрение корпоративных платформ и платформ для медицинского обслуживания, проведение аналитики, разработку эффективных алгоритмов для анализа больших данных.
Некоммерческая организация, занимается подготовкой высококвалифицированных специалистов в области биоинформатики и популяризацией биоинформатического знания в России.
Миссия Института — становление России как мирового исследовательского центра в области биоинформатики.
Помимо ежегодных образовательных программ, Институт биоинформатики проводит регулярные мероприятия для состоявшихся специалистов, как биологического, так и технического профиля, которые желают повысить свою квалификацию и получить актуальные знания.
В 2015 году в Институте открылось исследовательское подразделение.
Миссия Института — становление России как мирового исследовательского центра в области биоинформатики.
Помимо ежегодных образовательных программ, Институт биоинформатики проводит регулярные мероприятия для состоявшихся специалистов, как биологического, так и технического профиля, которые желают повысить свою квалификацию и получить актуальные знания.
В 2015 году в Институте открылось исследовательское подразделение.
Санкт-Петербург
Заставская 22А
МегаПарк
Заставская 22А
МегаПарк
Вопросы?
Если у вас остались вопросы — пишите нам:
[email protected]
[email protected]